随着战斗的不断推进，莽军的阵脚逐渐被打乱，士兵们开始出现逃亡的现象。然而，就在这时，天空突然变得阴云密布，狂风大作，电闪雷鸣。紧接着，一场暴雨如注而下，河水汹涌泛滥，莽军的营寨被淹，许多士兵来不及逃跑，就被洪水吞噬。

在风雨和绿林军的双重打击下，莽军彻底崩溃，士兵们纷纷丢弃武器，四散奔逃。绿林军乘胜追击，斩杀莽军无数，王莽精心组建的四十二万大军几乎全军覆没。

昆阳之战结束后，绿林军取得了决定性的胜利。此时，有部下向刘秀建议，应当继续率军追击残余的莽军，彻底消灭敌人的有生力量。刘秀却摇了摇头，制止了这一行动。他知道，王莽虽然主力丧失，但在各地仍有残余势力，此时的莽军已经如同惊弓之鸟，失去了继续作战的勇气和组织性。穷寇莫追，若是此时强行追击，不仅可能会因为地形不熟、敌情不明而遭受不必要的损失，还可能给敌军以喘息之机，使其有机会重新组织抵抗。

此外，刘秀还考虑到，绿林军经过昆阳大战，虽然取得胜利，但士兵们也已疲惫不堪，需要休整补充。而且，此时其他地方的起义军也需要支援和整合，以稳定战后的局势。

于是，刘秀果断下令，停止对莽军残部的追击。他命令绿林军在昆阳附近休整，同时积极与其他地区的起义军联系，共同商讨下一步的战略部署。

在随后的日子里，刘秀的这一决策被证明是十分正确的。王莽的新莽政权在昆阳之战后迅速土崩瓦解，各地纷纷响应绿林军，起义军的声势愈发浩大。最终，在绿林军和其他起义军的共同打击下，王莽被杀，新莽政权宣告灭亡，汉朝得以复兴。

“穷寇莫追” 这个成语正是源于刘秀在昆阳之战后的这一战略决策。它揭示了在战争或其他对抗中，当敌人已经被打败并处于困境时，不要过于逼迫或追击，以免陷入不利的局面或遭受不必要的损失。这一智慧的军事原则在后世的战争实践中被广泛应用和验证，成为兵家所遵循的重要准则之一。